Tahun akademik 2013/2014 UNY menerima mahasiswa baru untuk D3 dan S1 sebanyak 5.642 orang dengan rincian mahasiswa Fakultas Ilmu Pendidikan (FIP) sebanyak 905 orang, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) sebanyak 892 orang, Fakultas Bahasa dan Seni (FBS) sebanyak 952 orang, Fakultas Ilmu Sosial (FIS) sebanyak 718 orang, Fakultas Teknik (FT) sebanyak 1.086 orang, Fakultas Ilmu Keolahragaan (FIK) sebanyak 485 orang, dan Fakultas Ekonomi (FE) sebanyak 604 orang.
Perkuliahan yang menurut rencana akan dilangsungkan mulai 2 September 2013 tersebut didahului dengan serangkaian acara seperti Orientasi Studi dan Pengenalan Kampus (Ospek) dan training ESQ yang dibuka oleh Rektor UNY Prof Dr Rochmat Wahab MPd MA di lapangan Hockey FIK UNY.
Pada tahun 2013 ini, dari 5.642 mahasiswa baru, yang diterima melalui jalur
BidikMisi sebanyak 980 orang padahal UNY memiliki kuota sebanyak 1.250 orang. Diharapkan para pengusul Bidik Misi melalui jalur Seleksi Mandiri dapat segera dirangkum dan dilakukan verifikasi, sehingga akan diperoleh sejumlah angka kuota yang benar-benar memenuhi syarat. Sementara itu mahasiswa baru Program Pascasarjana (PPs) tahun 2013 sebanyak 865 orang yang terdiri atas S2 sebanyak 788 orang dan S3 sebanyak 77 orang. Mereka yang D3 dan S1 berasal dari 32 propinsi yang ada di wilayah Indonesia dan 3 orang mahasiswa asing. Sementara mereka yang diterima di PPs berasal dari 31 propinsi.
Prof Rochmat Wahab mengungkapkan bahwa jumlah peminat calon mahasiswa yang ingin masuk UNY semakin banyak. Tinggi dan meningkatnya angka animo itu tidak bisa lepas dari prestasi UNY yang akhir-akhir ini semakin mantap. Tahun 2012 jumlah animo mahasiswa baru UNY sebanyak 82.534 orang dan pada tahun 2013 jumlah peminat yang ingin menjadi mahasiswa UNY mencapai sekitar 97.256 orang, terinci dari 43.842 orang lewat jalur
SNMPTN, 45.496 orang lewat jalur SBMPTN, dan 7.918 lewat orang jalur SM. "UNY sejak 2009 hingga 2012 mencapai predikat Wajar Tanpa Pengecualian (WTP) untuk pengelolaan keuangan selama 4 tahun berturut-turut yang menggambarkan tingkat keterbukaan dan transparansi serta akuntabilitas pengelolaan keuangan," katanya.
Tahun 2011 UNY memperoleh predikat pelayanan publik prima yang menggambarkan tingkat kepuasan terhadap layanan bagi stakeholders dan pada tahun 2012 serta 2013 UNY telah mengukir prestasi bidang seni, olahraga, akademik dan kreativitas, serta bidang khusus yang sungguh menggembirakan yang diindikasikan dengan prestasi.
Rektor berharap, para mahasiswa baru tahun akademik 2013/2014 yang memiliki potensi apapun jenisnya, dapat memanfaatkan waktu yang lebih produktif untuk meneruskan prestasi-prestasi kakaknya dan menambah prestasi di bidang lainnya serta mampu meraih prestasi pada tingkat yang lebih tinggi. Segenap jajaran pimpinan UNY akan terus meningkatkan perhatian dan dukungannya kepada semua sivitas akademika UNY, khususnya mahasiswa untuk berprestasi yang lebih optimal, sehingga dapat mengibarkan bendera UNY setinggi-tingginya
Dengan begitu UNY semakin dikenal oleh masyarakat yang lebih luas. Pembukaan Ospek UNY ditandai dengan pemakaian jas almamater oleh Rektor pada 2 orang wakil mahasiswa yaitu Aditya Rizka Puspita dari Pendidikan Biologi FMIPA dan Yusuf Royhan Rais dari Pendidikan Jasmani Kesehatan dan Rekreasi FIK diikuti seluruh mahasiswa baru UNY yang hadir. Ospek berlangsung selama 5 hari, hari pertama diisi dengan orasi ilmiah oleh Menteri Pemuda dan Olahraga Republik Indonesia KRMT Roy Suryo Notodiprojo, hari kedua display unit kegiatan mahasiswa UNY, dan hari ketiga hingga kelima penyampaian materi di fakultas masing-masing.